第十四章 生存分析

第一节 Life Tables过程

14.1.1 主要功能

14.1.2 实例操作

第二节 Kaplan-Meier过程

14.2.1 主要功能

14.2.2 实例操作

第三节 Cox Regression过程

14.3.1 主要功能

14.3.2 实例操作

 

    在临床诊疗工作的评价中,慢性疾病的预后一般不适合用治愈率、病死率等指标来考核,因为其无法在短时间内明确判断预后情况,为此,只能对患者进行长期随访,统计一定时期后的生存或死亡情况以判断诊疗效果。这就是生存分析。

 

第一节 Life Tables过程

 

14.1.1 主要功能

    调用此过程时,系统将采用即寿命表分析法,完成对病例随访资料在任意指定时点的生存状况评价。

 

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14.1.2 实例操作

   [例14-1 用中药+化疗(中药组,16例)和单纯化疗(对照组,10例)两种疗法治疗白血病患者后,随访记录存活情况如下所示,试比较两组的生存率。

 

中药组

对照组

随访月数

是否死亡

随访月数

是否死亡

10

2

12

13

18

6

19

26

9

8

6

43

9

4

31

24

2

13

7

11

6

1

11

3

17

7

 

14.1.2.1  数据准备

    激活数据管理窗口,定义变量名:随访月数的变量名为TIME,是否死亡的变量名为DEATH,分组(即中药组与对照组)的变量名为GROUP。输入原始数据:随访月数按原数值;是否死亡的,是为1,否为0;分组的,中药组为1,对照组为2

 

14.1.2.2  统计分析

    激活Statistics菜单选Survival中的Life Tables...项,弹出Life Tables对话框(图14.1)。从对话框左侧的变量列表中选time,点击Ø钮使之进入time框;在Display Time Intervals栏中定义需要显示生存率的时点,本例要求从0个月显示至48个月,间隔为2个月,故在0 through框中输入48,在by框中输入2。选death,点击Ø钮使之进入Status框,点击Define Event...钮弹出Life Tables:Define Event for Status Variable对话框,在Single value栏中输入1,表明death = 1为发生死亡事件者;点击Continue钮返回Life Tables对话框。选group,点击Ø钮使之进入Factor框,点击Define Range...钮,弹出Life Tables:Define Range for Factor Variable对话框,定义分组的范围,在Mininum框中输入1,在Maxinum框中输入2,点击Continue钮返回Life Tables对话框。

 

 

14.1  生存资料的寿命表分析对话框

 

       点击Options...钮弹出Life Tables: Options对话框,在Plot栏中选Survival项,要求绘制生存率曲线图;在Compare Levels of First Factor栏中选Overall项,要求作组间生存状况的比较。之后点击Continue钮返回Life Tables对话框,再点击OK钮即完成分析。

 

14.1.2.3  结果解释

       在结果输出窗口中将看到如下统计数据:

       共有26个观察对象进入分析。系统先显示中药组(group = 1)的生存状况寿命表,按用户指定,从0月起,隔2个月直至42个月(原指定从048个月,但因42个月后,生存概率已为0,故42个月后至48个月的生存状况不再显示),分别显示进入该时点例数(Number Entrng this Intrvl)、从该时点失去的例数(Number Wdrawn Durong Intrvl)、该时点暴露于死亡危险的例数(Number Exposd to Risk)、该时点死亡的例数(Number of Termnl Events)、该时点死亡概率(Propn Terminating)、该时点生存概率(Propn Surviving)、该时点末生存率(Propn Surv at End)、单位时点的累积概率(Cumul Probability Densty)、该时点风险比例(Hazard Rate)、生存率的标准误(SE of Cumul Surviving)、单位时点累积概率的标准误(SE of Probability Densty)、风险比例的标准误(SE of Hazard Rate)。如本例,用中药+化疗的方式治疗白血病患者,至8个月时,死亡率为17.39%,生存概率为82.61%,生存率为66.38%,风险比例为9.52%。至42个月时,生存概率和生存率均为0,此时风险比例为100%。中药组的50%生存率在19.44个月。

       对照组同类结果的显示,因在16个月时生存概率已为0,故仅从0月起,隔2个月至16个月止。分析显示,单纯用化疗,白血病患者的半数生存率约在16个月多一点,比中药组少三个月。

 

This subfile contains:      26 observations

 

 Life Table

   Survival Variable  TIME

                 for  GROUP =  1

    Number Number Number Number                   Cumul        SE of  SE of

Intrvl Entrng Wdrawn Exposd   of    Propn  Propn Propn  Proba-       Cumul  Proba-  SE of

Start  this   During   to   Termnl  Termi-  Sur-  Surv   bility  Hazard  Sur-  bility   Hazard

Time  Intrvl  Intrvl   Risk  Events  nating  viving  at End Densty  Rate  viving  Densty   Rate

------  ------  ------   ------  ------   ------   ------  ------  ------   ------  ------   ------   ------

  .0   16.0    .0    16.0    .0    .0000  1.0000 1.0000  .0000  .0000  .0000  .0000   .0000

 2.0   16.0    .0    16.0   1.0    .0625   .9375  .9375  .0313  .0323  .0605  .0303   .0322

 4.0   15.0   1.0    14.5    .0    .0000  1.0000  .9375  .0000  .0000  .0605  .0000   .0000

 6.0   14.0    .0    14.0   2.0    .1429   .8571  .8036  .0670  .0769  .1019  .0441   .0542

 8.0   12.0   1.0    11.5   2.0    .1739   .8261  .6638  .0699  .0952  .1231  .0458   .0670

10.0    9.0   1.0     8.5    .0    .0000  1.0000  .6638  .0000  .0000  .1231  .0000   .0000

12.0    8.0   1.0     7.5   1.0    .1333   .8667  .5753  .0443  .0714  .1348  .0420   .0712

14.0    6.0    .0     6.0    .0    .0000  1.0000  .5753  .0000  .0000  .1348  .0000   .0000

16.0    6.0    .0     6.0    .0    .0000  1.0000  .5753  .0000  .0000  .1348  .0000   .0000

18.0    6.0   1.0     5.5   1.0    .1818   .8182  .4707  .0523  .1000  .1453  .0489   .0995

20.0    4.0    .0     4.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

22.0    4.0    .0     4.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

24.0    4.0   1.0     3.5    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

26.0    3.0   1.0     2.5    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

28.0    2.0    .0     2.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

30.0    2.0   1.0     1.5    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

32.0    1.0    .0     1.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

34.0    1.0    .0     1.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

36.0    1.0    .0     1.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

38.0    1.0    .0     1.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

40.0    1.0    .0     1.0    .0    .0000  1.0000  .4707  .0000  .0000  .1453  .0000   .0000

42.0    1.0    .0     1.0   1.0   1.0000   .0000  .0000  .2354 1.0000   .0000  .0727   .0000

 

 The median survival time for these data is  19.44

 

Life Table

   Survival Variable  TIME

                 for  GROUP =  2

    Number Number Number Number                   Cumul        SE of  SE of

Intrvl Entrng Wdrawn Exposd   of    Propn  Propn Propn  Proba-       Cumul  Proba-  SE of

Start  this   During   to   Termnl  Termi-  Sur-  Surv   bility  Hazard  Sur-  bility   Hazard

Time  Intrvl  Intrvl   Risk  Events  nating  viving  at End Densty  Rate  viving  Densty   Rate

------  ------  ------   ------  ------   ------   ------  ------  ------   ------  ------   ------   ------

  .0   10.0   1.0     9.5    .0    .0000  1.0000 1.0000  .0000  .0000  .0000  .0000   .0000

 2.0    9.0   1.0     8.5   1.0    .1176   .8824  .8824  .0588  .0625  .1105  .0553   .0624

 4.0    7.0    .0     7.0    .0    .0000  1.0000  .8824  .0000  .0000  .1105  .0000   .0000

 6.0    7.0   2.0     6.0   1.0    .1667   .8333  .7353  .0735  .0909  .1628  .0678   .0905

 8.0    4.0    .0     4.0    .0    .0000  1.0000  .7353  .0000  .0000  .1628  .0000   .0000

10.0    4.0   1.0     3.5   1.0    .2857   .7143  .5252  .1050  .1667  .2122  .0918   .1643

12.0    2.0   1.0     1.5    .0    .0000  1.0000  .5252  .0000  .0000  .2122  .0000   .0000

14.0    1.0    .0     1.0    .0    .0000  1.0000  .5252  .0000  .0000  .2122  .0000   .0000

16.0    1.0   1.0      .5    .0    .0000  1.0000  .5252  .0000  .0000  .2122  .0000   .0000

 

 The median survival time for these data is  16.00+

 

 

       接着显示两组比较的结果。系统采用Gehan比分检验法,得u = 0.012P = 0.9113,即中药组与对照组的生存率无差别。

 

Comparison of survival experience using the Wilcoxon (Gehan) statistic

   Survival Variable  TIME

          grouped by  GROUP

  Overall comparison    statistic  .012     D.F. 1        Prob.  .9113

  Group  label                Total N   Uncen    Cen   Pct Cen   Mean Score

    1                          16       8       8     50.00        .1875

    2                          10       3       7     70.00       -.3000

 

 

       最后,系统输出生存率曲线图(图14.2)。从图中可见,对照组(group = 2)在8个月前一段时点的生存率均较中药组(group = 1)略低,而8-12个月这一段其生存率又较中药组略高,12个月后再又下降。但在治疗中加用中药,对个别患者而言,20个月后依然有一定的生存率。

 

 

14.2  中药组与对照组生存率曲线的比较

 

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第二节 Kaplan-Meier过程

 

14.2.1 主要功能

    调用此过程,系统将采用Kaplan-Meier方法,对病例随访资料进行生存分析,在对应于每一实际观察事件时点上,作生存率的评价。

 

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14.2.2 实例操作

   [例14-225例某癌症病人在不同时期经随机化分配到AB治疗组进行治疗,同时随访观察至1974531日结束,资料整理后如下表,试对其结果进行生存率分析。

 

病人号

随访天数

是否死亡

治疗方式

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24

25

8

180

632

852

52

2240

220

63

195

76

70

8

13

1990

1976

18

700

1296

1460

210

63

1328

1296

365

23

A

B

B

A

A

B

A

A

B

B

B

A

B

B

A

B

B

A

A

B

A

A

B

A

B

 

14.2.2.1  数据准备

    激活数据管理窗口,定义变量名:随访天数为TIME,是否死亡为DEATH,治疗方式为TREAT。变量TIME按原数值输入,DEATH为是的输入1、否的输入0,TREAT为A的输入1、为B的输入2。

 

14.2.2.2  统计分析

    激活Statistics菜单选Survival中的Kaplan-Meier...项,弹出Kaplan-Meier对话框(图14.3)。从对话框左侧的变量列表中选time,点击Ø钮使之进入time框;选death,点击Ø钮使之进入Status框,点击Define Event...钮弹出Kaplan-Meier:Define Event for Status Variable对话框,在Single value栏中输入1,表明death = 1为发生死亡事件者;点击Continue钮返回Kaplan-Meier对话框。选treat,点击Ø钮使之进入Factor框。

 

 

14.3  Kaplan-Meier法生存率分析对话框

 

       点击Save... 钮弹出Kaplan-Meier:Save New Variables对话框,选Survival项,要求将各观察样例的生存率存入原始数据库中。点击Continue钮返回Kaplan-Meier对话框。

       点击Options...钮弹出Kaplan-Meier: Options对话框,在Plot栏中选Survival项,要求绘制生存率曲线图。之后点击Continue钮返回Life Tables对话框,再点击OK钮即完成分析。

 

14.2.2.3  结果解释

       在结果输出窗口中将看到如下统计数据:

       先对A治疗组资料进行分析。将原资料按生存天数的大小顺次排列,再逐例显示生存状态(Status,即死亡为1、生存为2)、生存率(Cumulative Survival)、生存率标准误(Standard Error)、累积死亡例数(Cumulative Event)和尚存活人数(Number Remaining)。如本例,A组共12人,死亡6人,生存6人,存活率为50.00%;平均生存时间为1023天,标准误为27695%可信区间为4821563天。B组共13人,死亡12人,生存1人,存活率为7.69%;平均生存时间为607天,标准误为22695%可信区间为1631051天。

 

Factor TREAT = A

 

  Time       Status     Cumulative     Standard     Cumulative      Number

                         Survival       Error         Events       Remaining

    8          1                                      1            11

    8          1         .8333        .1076            2            10

   52          1         .7500        .1250            3             9

   63          1                                      4             8

   63          1         .5833        .1423            5             7

  220          1         .5000        .1443            6             6

  365          0                                      6             5

  852          0                                      6             4

 1296          0                                      6             3

 1328          0                                      6             2

 1460          0                                      6             1

 1976          0                                      6             0

 

 Number of Cases:  12        Censored:   6      ( 50.00%)   Events: 6

 

          Survival Time    Standard Error   95% Confidence Interval

 Mean:         1023           276           (482,  1563 )

 (Limited to     1976 )

 Median:        220     &n