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口腔医学系成立于1984年，2001年10月改系建院。建系至今共培养本科毕业生322人、研究生7人 ，历届考上硕博士研究生28人，就业率100%。
学院教师中，有福建省“百千万人才工程”1人，校学科带头人3人，校青年骨干教师3人，副教授以上职称22人，博士5人，硕士6人。教师平均年龄36.1岁。
近3年，有2名博士获国家公派分赴美国哈佛大学和英国伦敦大学留学，15名医师到北京、上海、华西等重点口腔医学院校进修学习。
我院闫福华院长的“组织工程技术用于治疗牙周疾病的实验与临床研究”课题获省科技厅重大科研项目。
在学校的支持下，聘请上海市组织工程重点实验室主任、国家组织工程首席科学家曹谊林为我校兼职教授，指导我院和全校组织工程研究的开展。
近3年来，学校和医院共同投入246.81万元，改造装修了学院的教室、实验室、多媒体教室，购买了牙颌架系统、咬颌力测定仪、教学仿真头颅等教学设备，改善了教学条件，提高了教学水平。省财政厅给予医院的教学、科研工作以大力支持，拔给专款建设中心实验室，为研究生培养和科研工作创造了良好条件。
根据口腔医学的培养目标，学院从对人才的知识、能力和素质的要求出发，进行课程改革与建设，在课程结构整体优化方面下功夫。我院“面向21世纪口腔医学专业课程体系改革的探索与实践”的课题为省教育厅重大课题，目前已开始实施，运作情况良好。
2002年起，本科生进行毕业论文答辩，至今两届学生参加了答辩。我院98级王承勇同学的毕业论文获校毕业生优秀论文二等奖。
1998年以来，全院获省、厅级各类科研课题33项。
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