病原生物学系于2001年5月建系，由原微生物学教研室、寄生虫学教研室和基因工程研究室合并而成。1994年微生物学被评为省级重点学科。微生物学及寄生虫学均于1985年获硕士学位授权，1998年合并并更名为病原生物学硕士点。2003年获病原生物学博士学位授权。病原生物学系现有教师13人，技术人员8人。教师中具有博士学位4人、在读博士1人，具有硕士学位3人，在读硕士1人，3人为校青年骨干教师。现承担6门课程不同层次学生的教学工作。多人在本校基础医学院或校级讲课比赛中获奖。完成教学论文10余篇。目前承担国家及省级科研项目10余项。获省级科技成果奖8项。